En 1221, le comte Bernhard von Wölpe transféra le monastère cistercien de Mariensee, qu’il avait fondé, vers son domaine de Catenhusen, situé au bord de la Leine.
Par la suite, le nom du monastère remplaça l’ancien nom du lieu. L'église du monastère, un édifice en brique à nef unique datant du XIIIe siècle, devint une église paroissiale après la Réforme.
Elle a pris son aspect actuel à la suite de travaux de rénovation en 1860.
À cette époque, le couvent fut transformé en un couvent protestant de femmes, ce qu'il est encore aujourd'hui.
C'est au presbytère de Mariensee qu'est né en 1748 le poète Ludwig Christoph Hölty, qui, en tant que membre du « Hainbund » de Göttingen, s'est fait connaître bien au-delà des frontières du royaume de Hanovre grâce à son chant « Üb immer Treu und Redlichkeit ».
Aujourd'hui, le monastère n'est pas seulement un lieu de culte, mais aussi un lieu de rencontre culturel. Des visites guidées, des expositions, des concerts et des séminaires permettent de découvrir l'histoire et la vie monastique.