Nel 1221 il conte Bernhard von Wölpe trasferì il monastero cistercense di Mariensee, da lui fondato, nella sua tenuta di Catenhusen sul fiume Leine.
In seguito, il nome del monastero soppiantò l'antico toponimo. La chiesa del monastero, un edificio in mattoni a navata unica del XIII secolo, divenne chiesa parrocchiale dopo la Riforma.
Assunse l'aspetto attuale in seguito a una ristrutturazione nel 1860.
Il convento fu allora trasformato in un convento evangelico femminile e tale è rimasto fino ad oggi.
Nella canonica di Mariensee nacque nel 1748 il poeta Ludwig Christoph Hölty, che, in qualità di membro della «Hainbund» di Gottinga, divenne famoso ben oltre i confini del Regno di Hannover grazie al suo inno «Üb immer Treu und Redlichkeit».
Oggi il monastero non è solo un luogo di culto, ma anche un centro di incontro culturale. Visite guidate, mostre, concerti e seminari consentono di avvicinarsi alla storia e alla vita monastica.